Sujets abordés
BIA-MS « on-a-chip »
Interactions moléculaires
Biologie moléculaire
BIA-MS « on-a-chip »
Objectifs
- Optimisation des étapes de prétraitement et d’analyse des échantillons biologiques
- Mise au point d’outils pour le diagnostic de pathologies humaines et le criblage de molécules médicamenteuses
partenaires
- Immutep SA (Châtenay Malabry, F)
- Promogene (Dijon, F)
- Biacore (Suède)
- Genoptics (Orsay, F)
- Centrales Technologiques:
- ARCEN (Dijon)
- MIMENTO (Besançon)
travaux réalisés
- Conception/réalisation de puces compatibles avec la technologie Biacore™
- Usinage de plaques d’échantillon pour MALDI-TOF
- Bio-Ingénieries des puces ADN et Protéines
- Capture d’entités biologiques et Identification de complexes biomoléculaires
résultats des travaux
- Digestion enzymatique on-chip et analyses MS MS
- Identification protéique à l’échelle femtomole
- MALDI-TOF « on-a-chip »
perspectives
- Analyses de fluides biologiques moyen débit
- Automatisation des procédés d’analyses
- Mise au point de puces à protéines (protein arrays) pour le criblage de molécules et la recherche de biomarqueurs
- Développement d’une plateforme microarrays « SPR-MS »:
Mots clés
- BIA-MS
- SPR
- MALDI-TOF TOF
- Biopuces
- Biomarqueurs
Contacts
- Axe Santé: Patrick Ducoroy, patrick.ducoroy[at]clipproteomic.fr
- Axe NaMiBio : Wilfrid Boireau, wilfrid.boireau[at]clipproteomic.fr
Interactions moléculaires
Objectifs
- Optimisation des processus de reconnaissances moléculaires
- Ingénieries biomoléculaires
- Fonctionnalisations chimiques et greffages de biomolécules
partenaires
-
Partenaires industriels
- Immutep SA (Châtenay Malabry, F)
- Promogene (Dijon, F)
- Biacore (Suède)
- Polypure (Norvège)
- Genoptics (Orsay, F)
-
Centrales Technologiques:
- ARCEN (Dijon)
- MIMENTO (Besançon)
-
Partenaires académiques
- Pr. Uwe Schlattner, INSERM U884: Laboratory of Fundamental and Applied Bioenergetics (LBFA) - University Joseph Fourier
- Pr. Sylvie Ricard-Blum , Institut de Biologie et Chimie des Protéines UMR 5086 CNRS - Université Lyon 1
- Pr. Pierre Pothier, Laboratoire de Virologie - Centre National de Référence des virus entériques Pôle de Biologie, CHU de Dijon
- Dr. Laurence Nicod, IFR-133 Besançon , EA4267 Sciences séparatives, biologiques et pharmaceutiques (2sbp)
Travaux réalisés
- Conception/réalisation de puces compatibles avec la technologie Biacore™
- Fonctionnalisations 2D (SAMs) hautement contrôlées
- Développements de biopuces lipidiques, ADN, protéines, virus et cellules
- Etudes des constantes cinétiques d’intéraction et captures d’entités biologiques
-
Biopuces Home-made
Modèles membranaires Puces à protéines Puces à cellule Modèle de Biopuces 
-
Protein Arrays
-
Matrice acoustique
résultats des travaux
- Réduction des adsorptions non spécifiques
- Contrôle de la densité surfacique en ligand
- Biopuces hautement spécifiques
- Analyses de fluides biologiques complexes
perspectives
- Mise au point de « protein arrays » pour le criblage de molécules et la recherche de biomarqueurs
- Automatisation des procédés d’analyses
- Développement de l’analyse SPR multiplexée
- Etude multiparamètre de cellules immobilisées
- Environnement de salle blanche (classe 10 000)
Mots clés
- AFM
- SPR
- Immunocapteurs
- Biopuces
- Biomarqueurs
- Microarrays
Contacts
- Céline Elie-Caille, céline.caille[at]clipproteomic.fr
- Wilfrid Boireau, wilfrid.boireau[at]clipproteomic.fr
Biologie moléculaire
Objectifs
- Utilisation d’outils pour la séparation, le fractionnement et la caractérisation des protéines
- Bioingenieries sur les molécules et macromolécules biologiques
- Développement d’ innovations technologiques pour la mise en évidence d’interactions macromoléculaires (protéine-protéine, protéine-ADN, membranes lipidiques-protéine)
partenaires
- IFR 100, IFR 133, ICB, FEMTO-ST
- Diaclone (Besançon, F)
- EFS (Besançon, F)
- CGM (Gif/Yvette)
travaux réalisés
En biochimie / biologie moléculaire
- Etiquetage des protéines (6 His, GST, GFP)
- Purification des protéines étiquetées (Chromatographies d'affinité)
En protéomique
- Séparation des protéines par la technologie chromatographie liquide bidimentionnelle (PF2D)
- Séparation des protéines par électrophorèse monodimentionnelle et bidimensionnelle
- Colorations des gels (Bleu de Coomassie, Bleu colloïdal, Nitrate d'argent)
- Western blot
résultats des travaux
- Développement d’une interface biospécifique originale pour la mise en évidence de l’interaction GEC1-tubuline par résonance plasmon de surface
-
Séparation des protéines
perspectives
- Caractérisation des interactions macro-moléculaires
- Identification de partenaires moléculaires de protéines qui interfèrent avec la progression des cancers
Mots clés
- Protéines recombinantes
- Cibles moléculaires
- Complexes protéiques
Contacts
- Régis Delage Mourroux, regis.delagemourroux[at]clipproteomic.fr
- Wilfrid Boireau, wilfrid.boireau[at]clipproteomic.fr
