Objectifs
- Recherche de biomarqueurs protéiques spécifiques d’états pathologiques dans le cadre d’études cliniques
- Mise au point et validation de procédures opératoires standard pour la purification et l’analyse de sous protéomes et/ou peptidomes à partir de fluides biologiques
- Obtention de contrôles de qualité nécessaires et indispensables pour la validation des études de protéomique clinique
- Développement de nouvelles méthodes pour un gain en sensibilité en adéquation avec les contraintes des études cliniques
- Mise en évidence de biomarqueurs protéique par spectrométrie de masse à partir de mélanges protéiques complexes (fluides biologiques, extraits cellulaires…)
partenaires
- CLCC JF Leclerc
- Cancéropole Grand Est
- INCa
- EFS-BFC
travaux réalisés
- Création d’un contrôle de qualité et production de 3000 paillettes identiques de plasma conservées à -296°C
- Validation des procédures opératoires standard sur robot TECAN MCA en format tête 96 aiguilles
- Développement et validation de nouvelles procédures de traitement des échantillons (fragmentation, déplétion…)
- Procédures et contrôles de qualité appliqués à l’analyse par spectrométrie de masse de type MALDI-TOF
résultats des travaux
- Capacité de traitement de 96 échantillons en parallèle
- Gain en reproductibilité intra et inter expérimentales
- Traçabilité de l’ensemble de la chaine analytique
- Gain en sensibilité pour la recherche de biomarqueurs
-
Disponibilité d’un outil de contrôle de la qualité (CQI):
- Mesure et contrôle de la reproductibilité expérimentale
- Validation de nouvelles procédures
Retombées par secteurs d’application
-
Recherche fondamentale :
- Etude protéomique comparative à haut débit
- Mise en évidence de nouvelle voie de signalisation
-
Recherche Clinique :
- Etude protéomique à grande échelle (> à 500 échantillons) pour la recherche de biomarqueurs
- Optimisation des procédés de traitement et d’analyse des échantillons
- Identification de nouveaux marqueurs protéiques
Mots clés
- Nanobiotechnologies
- Capteurs
- Biopuces
- Microtechnologies
Contacts
- Patrick Ducoroy, patrick.ducoroy[at]clipproteomic.fr
- Wilfrid Boireau, wilfrid.boireau[at]clipproteomic.fr
